虽然尿素是我国目前农业最常用的氮肥品种之一，但在使用中也存在以下问题：。尿素是我国目前农业最常用的氮肥品种之一，使用的普遍率仅次于碳酸铵。尿素属有机氮肥，含氮率高，物理性能好，不易挥发散失，很受农民朋友欢迎
因此，将尿素地表撒施或浅施不严密覆土，同样也会造成尿素的挥发散失，只是时间稍晚一些而已。地表撒施或浅施一些农民施用尿素时开沟较浅，覆土也不细致严格，甚至干脆撒施，任尿素暴露于地表，这是一种极其错误的做法。这是因为尿素虽然物理性质较稳定，不易挥发散失，但在土壤微生物的作用下，也会向碳酸铵那样挥发散失
尿素的正确施用方法开沟或开穴7~10厘米深施，施后马上严密覆土。追施时夏季间隔2~3天，春秋季间隔6~8天后浇水，以免造成尿素肥效流失。此施用方法可大大降低尿素的肥效损失，提高尿素的有效利用率，使尿素的有效利用率达到最大值
施肥后马上浇水农民在施用尿素后马上浇水，以为这样可以使尿素马上融化，肥效快，其实则不然。这是因为尿素施入土壤后，以分子状态存在于土壤溶液中，在转化成为碳酸铵前，不易被土壤胶体所吸附，容易随水流失。因此，尿素施用后马上浇水，尿素便会随水附至20厘米以下的土壤深层，不易被作物吸收利用，从而造成浪费