被害种子的蛋白质含量明显降低，主要症状是茎基部出现黑褐色病斑，并向上不同程度扩散至下部侧枝，使病茎髓部变褐，叶柄基部缢缩，叶片下垂，但不脱落。药剂防治主要应用58%瑞毒霉锰锌或72%克露可湿性粉剂，用量均为种子量0.3—0.4%拌种。1.大豆根腐病：该病在大豆整个生育期均可发生并造成危害，减产幅度在25—75%或更多
豆荚从嫩荚期开始发病，鼓粒期为发病盛期，7—8月份遇高温多雨年份发病重。主要危害叶片，严重发病时几乎所有叶片长满病斑，造成叶片过早脱落，受害减产20—30%，同时百粒重下降，品质降低。药剂防治：除在播种时用70%敌克松可湿性粉剂或50%福美双可湿性粉剂按种子量的0.3%拌种外，在大豆花荚期，每公顷用40%多菌灵胶悬剂1.5公斤，兑水450公斤喷雾。3.大豆灰斑病：又称斑点病，一般在6月上中旬叶上开始发病，7月中旬进入发病盛期
2.大豆菌核病：大豆菌核病主要浸染茎杆，7月下旬开始发病，浸染初期茎杆上有褐色病斑，以后病斑上有白色棉絮状菌丝体及白色颗粒，后变黑色颗粒（菌核）。药剂防治用50%速克灵可湿性粉剂1000倍液或40%核菌净1000倍液或50%甲基托布津500倍液喷雾。纵剖病株茎杆，可见黑色园柱形老鼠屎样的菌核，病株枯死后呈灰白色