植物叶绿体中含有锰，锰能促进种子发芽和幼苗时期生长，缺锰时影响作物的光合作用、呼吸作用、硝态氮在体内的积累。表现为叶片脉间失绿黄化，有褐色斑点，并逐渐增多散布于全叶，使叶片变成红灰色，叶片皱缩
硼能促进生殖器官的正常发育，缺硼的一个重要症状是籽实不能正常发育，甚至不能形成，从而影响作物的收成。缺硼时，根瘤不发达，影响固氮量。硼可以提高豆科作物根瘤菌的固氮活性，增加固氮量。硼还能增强作物抗逆性。硼对作物体内糖的合成和运输有促进作用，缺硼时叶绿体退化，影响光合作用
锌能促进作物进行光合作用，缺锌时作物生长发育出现停滞
缺钼时植株矮小，叶片脉间失绿，叶缘枯焦，向内卷曲，呈萎蔫态。同时又能增进叶片光合作用强度。钼是固氮微生物，特别是与豆科作物共生的根瘤菌固定大气氮素时所必需的
因此，当作物缺乏任何一种微量元素时，生长发育就受到抑制，导致减产和品质下降，严重的甚至绝收。微量元素在作物体内含量虽少，但具有很强的专一性，是作物生长发育所不可缺少和不可相互替代的。反之，如果这些元素过多，又会出现中毒现象，影响作物产量和质量，还会引起人、畜的某些地方病的发生。微量元素是指土壤和植物中含量很低的营养元素，目前研究和使用较多的有铁、铜、锌、锰、钼、硼等6种
另外，铁对植物的光合作用、呼吸作用都有影响。缺铜时，植株生长瘦弱，新叶发黄，凋萎干枯，叶尖卷曲发白，有坏死斑点。铁是叶绿素形成不可缺少的，在植株体内很难转移，所以叶片“缺绿症”是植物缺铁的表现，并且这种失绿首先出现在幼嫩叶片上