可于秋分寒露间进行，若生长期进行分株，则会生长不良，甚至会造成死亡。繁殖牡丹最简便的方法是分株。寒冬及春季株也容易死亡
分株后伤口处最好用硫酸铜或高锰酸钾溶液涂抹消毒，以感染病害。第二年3月中、下旬再打开。栽植时根理直，不可扭曲。栽好覆士并踩实，连续浇几次水，使土壤完全沉实，与根接触密实。华北地区天寒，第一年要保护越冬，用3层旧报纸将植株包裹即可。裹前要先用草绳将枝条捆拢，捆前用一剪把叶子剪去，保留一部分叶柄的保护芽不致碰坏。选择好合适的栽培地点(地势稍高，排水良好，阴凉、肥沃处)挖好坑后，喷洒一些敌敌畏等药剂防止害虫伤根
因牡丹根较深，挖时要离根些，挖得深些。若主干是独干或干很少，无株可分，可在春天培土高10厘米，并保持湿润，待基部长出新枝新根，第二年秋天再进行分株，这样对母株便无影响。去除败枝朽根，用利刀顺其自然从根上劈下(或手扒也可以)，注意不使根芽损伤，每一分株保留适量的根系及颈处的蘖芽。牡丹根系肥大，容易折断，掘起后阴干1—2天再劈。分株时，先将植株(全株)掘起