祖国医学认为：木瓜能理脾和胃，平肝舒筋，可走筋脉而舒挛急，为治一切转筋、腿痛、湿痹、脚气的要药。木瓜又称宣木瓜，性温，味酸，气香，入肝、脾二经。临床上常用木瓜治疗风湿性关节炎、腰膝酸痛、脚气、小腿肌肉痉挛、消化不良、吐泻、腹痛等疾病
以木瓜、虎骨为主药，加入川芎、秦艽、牛膝等十多味中药配制而成的虎骨木瓜酒，则具有祛风除湿、舒筋活络、散瘀活血、止痛定麻的功效。木瓜酒可治风湿筋骨痛、腰膝酸痛、跌打扭伤、筋肉痉挛等症，对妇女产后腰酸背痛、腰脊劳损亦有治疗效果。我国历来有用木瓜制成药酒饮用，治疗各种疾病的方法
木瓜有缓和胃肠痉挛和四肢痉挛的作用，尤其对腓肠肌痉挛（小腿抽筋）有明显的治疗作用。古书记载，木瓜煎水洗头，还能增加头发光泽。木瓜还有一种木瓜酸素，可帮助分解人体胃肠里多余的动物性蛋白质，可调整胃肠消化功能。对消化不良和胃病患者，可帮助消化，食之有益。现代药理实验表明，木瓜含有糖类、蛋白质、脂肪、矿物质、维生素A、维生素C、皂甙、黄酮类、果胶、苹果酸、酒石酸、枸橼酸等有机酸成分。木瓜煎水饮用，对关节有明显消肿作用