植株管理及病虫害防治马蹄莲植株管理比较简单。主要是剥除黄叶和部分外叶。马蹄莲的病虫害主要有细菌性软腐病、蚜虫、红蜘蛛等。剥除外叶的目的是避免叶片拥挤影响采光通风，并防花梗伸出。细菌性软腐病可危害叶、叶柄和块茎，主要由块茎带菌传播，初发病时可用波尔多溶液500倍喷雾防治
整个生长期间，营养液PH值均要调到5.6至6.5。营养液管理马蹄莲无土栽培营养液可采用下列的营养液配方：硝酸钙800克、磷酸二氢钾210克、硫酸镁250克、硝酸钾500克、硝酸铵30克、乙二胺四乙酸铁盐10克、硫酸锰2克、硫酸锌1克、硼酸1.3克、硫酸铜0.15克、钼酸铵0.1克。营养液供应量主要根据天气情况与植株大小而定，一般一天供液2至3次，保证栽培基质层湿润，槽底有一层浅水层即可