1、处理病残体。木瓜收获后，结合冬季修剪，剪除病枝，摘除病果，集中烧毁，能有效的减少越冬菌源
一、症状：褐腐病主要危害果实，也能危害花和嫩梢。病果失水后，变成褐色僵果，挂在枝头，经久不落，花梗上或果实上的病菌，侵害枝条，形成褐色溃疡斑，影响养分和水分的正常输送，抑制枝条的生长发育，造成枝条枯死。果实发病，初为褐色近圆形的小病斑，后随着病情的发展，病斑不断扩大，条件适宜时，病斑很快扩展全果表面，并逐渐向果肉延伸，严重时，使整个果实腐烂
病菌在僵果上越冬，病枝上病菌越冬后也能侵染。5月上旬前后，当幼果形成后，病菌多从果实伤口处侵入。降雨早或多的年份，发病早且重，栽培地低洼，易受渍涝，树势弱也适宜于发病。果实膨大期，若遇狂风暴雨、冰雹等自然灾害，给果实表面造成的伤口多，也有利于病菌的侵入而发病。二、发病规律：该病属真菌病害，其无性世代是半知菌亚门的丛梗孢属。因此，虫害重，虫伤多褐腐病也就严重。次年春季，气温回升后，病果、病枝上的病菌产生分生孢子，借风雨传播
三、防治方法
早春在木瓜发芽前，喷1次波美5度的石硫合剂；3-4月份木瓜谢花后至果实采收前，可每隔10-15天，喷1次50%多菌灵500倍或50%甲基托布津800倍液，连喷2-3次，并可兼治叶部病害。2、药剂防治
防治方法：在幼虫孵化期，喷90%晶体敌百虫1000倍液或杀螟松乳剂1500倍液，每7天1次，连喷3次。3、防虫伤。不仅纵横串食果肉，且造成虫伤口，有利于病菌侵入。桃蛀螟是危害木瓜果实的重要害虫，6月中下旬，正当木瓜果实膨大时，雌蛾将卵产于果实梗凹和贴缝空隙处，幼虫孵化后，即咬破果皮蛀入果内