若父本系与母本系的花期相差较大(10天以上)时，可先移栽迟花系统，后栽早花系统，以调节花期相遇。有时也会因环境条件的变化而使父母本花期稍有差别，必要时可对抽薹过早的亲本实行重摘心，即摘去植株主花，促进下部侧枝萌发，延迟开花。重摘心一般不会影响种子产量
自交不亲和系需通过蕾期授粉繁殖亲本，由于每荚结籽少，通常只有3~10粒种子，繁殖系数低，制种成本高，因此，萝卜主要利用雄性不育系配制一代杂种。萝卜杂种优势极明显，一代杂种在生产上应用较多。萝卜杂交制种的途径有自交不亲和系和利用雄性不育系两种
以上三系每代均需采用过地留种法繁殖原种，而且栽培管理水平要高，采收肉质根时需严格选择，以保证原种的典型性。三系的繁殖最好分别设立隔离的繁殖圃，即设一圃繁殖不育系(圃内种植不育系和保持系，种植行比为3~5∶1)，另设二圃分别繁殖保持系与父本系，严格防止生物学混杂，隔离距离需在2500米以上。亲本的保存与繁殖。萝卜的雄性不育性属于核质互作型，利用此类雄性不育系制种时，必须有不育系(杂种一代的母本)、保持系(繁殖不育系的父本)和父本系(杂种一代的父本)三系配套
一代杂种的生产。一代杂种种子的生产可采用过地留种或自地留种，隔离距离应在l000米以上，制种区内，按4~5∶1的行比种植不育系和父本系，生长前期结合间苗定植除去杂株，初花期要特别注意拔除不育系中出现的个别能育株，一般每隔l~2天检查一次，开花后父母本任其自然授粉，或人工放养蜜蜂辅助授粉，当75％左右有效花序开花授粉结束时，可撤走蜜蜂，拔除父本，以防父母本花序交叉。收获时易造成混杂