在碗莲的繁殖中，通常采用播种繁殖和分藕繁殖。播种繁殖又称为“有性繁殖”，分藕繁殖又称“无性繁殖”或“营养繁殖”
生长期地下茎分生繁殖
此时地下走茎沿钵壁转圈生长，茎节上又生出侧枝走茎，侧枝走茎上又长出浮叶和立叶。（2）操作方法一般于6月下旬，当碗莲已长立叶7片左右时进行分生繁殖。最后将母株地下走茎轻轻压入泥中壅泥填平，呈原先状况。选择侧枝上刚长出水面5厘米左右，还没放开的立叶(呈纵卷状)，用手沿钵壁轻轻取出走茎，即可看到侧枝立叶下长满白色不定根，并有顶芽。用小刀切断侧枝走茎，注意不要碰断顶芽，即可得到一个有根的小植株个体
如果新育成的品种系通过现有的品种多代自交，形成纯系，或杂交种自交，定向选育成为性状稳定的品种，则可建立隔离区大量产纯合种子。碗莲的播种繁殖，主要用于可心结实的纯系或以选种育种为目的的种植
必须注意，剥壳部位不宜过大过多，如果把莲子的硬壳全部去掉，胚芽就会失去保护，极易腐烂死亡
（1）选择母株据试验，一般性碗莲品种都可采用此法繁殖。母株应选择当年4月上中旬播种或分栽的生长茁状，无病虫害，分枝力强的植株
外地引种，藕身污泥不必洗净，可垫湿水草，洒上水，分层装篓，一般保存15天左右仍可成活。翻盆的种藕，如果当天栽不完，则可置于避风避阳的盛水的缸钵中，浸没顶芽部分，如此”假植”半个月左右也不会影响发芽。也可将种藕放在避寒、避风、荫蔽处，下层放上稻草，洒上水，放置种藕，再盖上一层稻草，并保持湿润
浸种一天后，待胚吸水膨胀，果皮吸水变软时，可以用手沿着破壳处剥去果皮的1/3，使胚外露，以利胚芽伸长。破壳最简便易行的方法是在水泥地面上或粗糙的石头上磨，也可用咬口锋利的新老虎钳夹破种子的基部。莲是倒生胚珠，胚芽着生于种子的顶端，破壳时应击破种子的基端，即种子在花托上着生的一端，也就是莲子凹入的一端。也可用锋利的快刀切割外皮，杨德高多年来用修剪果树的修枝剪反持剪法很好，[莲籽就如我们食用的板粟一样的结构]播种前一般只要磨破果皮(即莲子的硬壳)，见到褐色种皮为止;夹壳时只要在基部夹2～3毫米裂口即可，切勿夹去太深，以免伤胚
受精后的早期阶段本有胚乳，在后期被胚吸收消失，故莲为无胚乳种子。种子由受精后的胚珠发育而来，由种皮及胚两部分组成。了叶两片，色白，肥厚，对生，贮藏丰富的蛋白质及淀粉，是人们食用的部分。在两子叶基部凹陷处胚轴的末断为胚根。胚芽绿色，具一段短的芽轴(茎)、两片互生的幼叶及一个顶芽，两片幼叶的叶柄及对折卷筒状的叶片雏形已可辨认。胚根极不明显，肉眼不能看见，但在种子萌发时，胚根即发育成初生根，突破种皮及坚硬的果皮露出。胚由胚芽、胚根、胚轴及子叶4个部分组成。果皮内包藏着种子。胚芽基部与两片子叶连接处为胚轴
播种繁殖
这种方法属营养繁殖，因此能保持母种的优良性状，并可成倍地提高繁殖系数，缩短碗莲繁殖周期，尤其有利于碗莲的商品化生产。由于人们对碗莲的渴求，采用常规的播种法和分藕繁殖，已不能满足需要，特别是新品种的扩繁，碗莲生长期地下茎分生繁殖已显示出其优越性：省时省力，易成活，长势强;如果分生时间恰当，则能够延续花期，起到控制花期的作用
同时由于有性繁殖是利用种子播种，其实在生后代有时会出现分离现象而不能保持品种的特性。所以在栽培实践中，有时为了保持品种的优良特性，也只能通过无性繁殖。碗莲由于种植在小钵内，营养条件有限，地下走茎分枝少，形成藕的支数也少，一般繁殖系数较低。莲的分藕繁殖，也就是营养繁殖，是指从上年栽培的碗莲母藕上取主藕或儿藕，甚至孙藕栽植。为了提高繁殖系数，加快繁殖速度，可以把碗莲种在稍大一些的容器里，以更好的生长和形成较多的种藕。对于高度重瓣化的品种，因其已完全丧失结实能力，所以只能靠分藕繁殖来扩大栽培
可把浸种盆直接放置在阳光下催芽，不需要保温，生长也快。碗莲播种繁殖具体步骤如下：。碗莲种籽首先要选择颗粒饱满、充分老熟，保存良好，无虫蛀无霉变，最好母本来源清楚的优良种籽。播种繁殖从3月至7月均可进行，长江中下游地区最好在4月左右进行播种。在正常气温下，如管理得当，一般当年即可开花
分藕繁殖
为了使莲子在播种后吸收水分和氧气，打破被迫休眠状态，进入萌发生长，在种子催芽前，必须进行破壳处理，而要恰当破壳，则应先了解莲子的基本结构。所以莲子可以在土中埋藏数百年甚至上千年而不萌发也不腐烂，这是莲子长寿的原因。（1）破壳处理莲子的果皮具有坚而厚的特殊结构，在种子充分成熟干缩以后，水份和空气不易透入，呼吸作用非常缓慢，处于被迫休眠状态
分生繁殖要把握好切割走茎的时机，过早切割往往侧枝尚短小，容易误切地下主走茎，影响到母株的正常生长，开花结藕减少;过迟切割，钵内走茎盘根错节，不但给操作带来不便，而且小植株薄壁细胞老化，缺乏活力，分生后不易成活或长势不旺，不能正常开花结藕
翻盆前，应检查一下盆内泥层干湿是否适度。翻盆时，将盆反扣，为了不损坏花盆，可将落地的盆边垫上稻草，然后小心散开泥块，取出新藕，栽入新盆中。在长江流域，清明前后是翻盆分藕分栽的适宜时期。若泥土太稀，苫芽落地容易碰断;泥土太干，则新藕取出困难，也会弄断苫芽。碗莲藕细如指，掰取藕芽时，应注意保留两三节藕身，并保留尾节，否则水易浸入藕体，容易引起种藕腐烂，导致生长受阻并可能死亡。过早分栽因气温低，且会寒流影响，种藕容易受冻害;过迟分栽，苫芽已经萌发，易碰断，对成活有影响
（2）浸种催芽将已破壳的种子，浸于50℃左右的温水中。水温自然下降，最后保持在30℃左右，不宜高于40℃或低于20℃。家庭少量浸种催芽时可放入保温瓶中保温。温度在30℃的条件下，一般浸种催芽3天即可萌发，胚芽从破口处伸出。如水温高于40℃时，种子虽在头一天萌发迅速，但以后生长则受到抑制;水温低于20℃时，则种子发芽生长过于缓慢。浸种的水要清洁，不含油腻、污物，也不要用高于50℃的水，否则会影响发芽
顶端荷卷(浮叶)向上埋入泥内，尾部半截藕身翘起不使藕尾进水。留有节的种藕，栽后藕身逐渐腐烂，为碗莲继续发芽、展叶提供养分。栽后把盆放置于阳光下晒，使表面泥土出现微裂，呈鸡爪痕状，以利于种藕与泥土完全粘合，然后加少量水。栽插时，藕秧顶端沿钵边呈20度斜栽入泥，即头低尾高。待芽长出后，逐渐加深水位，最后保持3～5厘米水层
果皮初为绿色，革质，老熟后转为黑褐色，逐渐变得坚硬。莲子的外层为果皮，由精后的子房发育而成，主要成分为纤维素。在高度角质化的表皮上具有气孔，气孔室直达果皮深处。在果皮中具有栅栏状的细胞，排列紧密，这些构造对种子有很好的保护作用
盆中用稻田土拌和少量腐熟的鸡粪，加水充分搅拌呈糊状。5天后可视其生长情况逐步移至阳光下，像正常碗莲一样管理，不久便会长出新的浮叶和立叶后结藕，有的当年可以开花。小植株上的顶芽一定要埋入泥下，保持水层3厘米，一定要放置于荫蔽处3-5天左右。（3）定植栽植分生植株的花盆可稍小、稍深，一般选用口径20厘米、高15厘米的花盆。本阶段分生植株能依靠不定根吸收养分，原来未放开的立叶就会放开，浮于水面，颇像浮叶。泥水澄清后，将切割的分生小植株栽植于花钵中央
移植时应注意，不可折断叶柄，叶是碗莲进行光合作用的，以免影响碗莲的正常生长。一般来说，多花品种，在长出5～17片立叶后可始现花蕾。浇水也不要过多，以提高水温，促进生长。没有发芽能力的种子往往会上浮到水面，胚芽发黄，子叶霉烂、发臭。在水培育苗过程中应保持水层深10厘米左右，并给予充足的光照;不宜经常换水或翻动，以免叶片因经常改变其生长方向而过度伸长;应让叶柄保持在水中，叶片自由平展于水面。最好是选择晴天的傍晚时定植，植后保持3～5厘米水层，但千万不可把叶片淹没水中。在水培育苗期间，莲苗根系吸收力弱，生长主要靠种胚提供养分，一般不需要施肥。待长出7～13片浮叶后即可出现立叶。一般在外部条件都适宜的情况下，超7天仍不发芽的种子，就不会再发芽了。（3）水培育苗种子出苗后，应在25℃左右条件下进行水培育苗5～7天。如果怕自己不能掌握不好的话，就控温在25度上下，这样就安全放心，如果在适宜季节和利用好晴天泡种那就是大大的省了心了，泡种在此期间内，最好是每天需换水1～3次，水要干净无污染，水温不要相差太多为好，换脏水并洗去沾液，同时及时清除莲籽出白沫不能发芽出苗的种子。现蕾早晚，视品种而异，有的品种在立叶长出之前就现蕾开花。幼苗娇嫩，遇阳光日灼有的会焦枯，但一般还会发芽成活。碗莲喜光，花钵应放置在阳光充足处