麦套棉不宜施用盖顶肥，以免造成晚熟。棉铃虫初孵幼虫百株虫率在5％时及时预防治理，卷叶株率达到5％时及时预防治理伏蚜。盛蕾期、初花期主茎日增长量超过3厘米时，每亩用矮壮素1-1.5毫升或助壮素3-4毫升，加水15公斤喷施。缺磷地块，可在8月份用磷酸二氢钾或磷酸二铵300-5000倍液根外追肥，每亩每次喷洒50-75公斤，每隔10-15天喷一次，共喷2-3次。适时打顶，麦套春棉在7月15-20日，麦套夏棉在7月20-25日，8月10-15日去掉全部无效花蕾。花铃期：早施、重施花铃肥，初花期每亩施尿素10-15公斤。盛花期注意培土，以防涝渍和倒伏。麦套棉二、三代棉铃虫和伏蚜危害较重
施肥量不宜过大，以防棉苗旺长。全田有1％棉株受害时，用久效磷5-10倍液涂茎，或者用100毫升有机磷农药或菊酯类农药拌25-30公斤细土，撒在棉苗附近，防止玉米螟由麦株向棉苗转移。麦收后常有玉米螟钻蛀危害棉株，小麦应随割随运，不留在田间。灭茬后早施追肥，每亩施尿素2.5-5公斤。麦收后：麦收后及时灭茬，破除土壤板结，促进棉苗生长和根系发育。施肥后浇提苗发棵水，以利于棉苗生长和养分吸收
麦收前适时浇水，防止干旱死苗。麦收前地老虎危害严重，可取90％晶体敌百虫1公斤，用少量温水化开后加水10公斤，喷洒在100公斤炒香地饼粉或麦麸上，于傍晚撒在田间诱杀，每亩用量2.5-3公斤。麦收前：棉花播种出苗后，及时查苗补缺。结合浇水及时施适量氮肥，促苗早发
实行麦田套种直播栽种培养棉花地田块，应做好麦收前、麦收后及花铃期地棉花管理工作，确保麦套棉丰收