选用抗病品种选用抗病品种是防治西瓜枯萎病最经济有效的措施。郑抗１号、郑抗２号、京抗２号、京抗３号等西瓜品种抗病性较好
播后每２００公斤营养土拌５０％多菌灵可湿性粉剂１公斤后撒入苗床盖种。选择无病田块营养钵育苗，带药浇底水。此外，可采用西瓜嫁接技术，控制病害发生。种子土壤消毒西瓜枯萎病是土传病害，对种子和土壤消毒可以控制和延缓病害发生。播前种子用５０％多菌灵５００倍液泡１小时
发病初期再用一次药，控制病害蔓延。适期用药防治定植时和初花期，用６５％喷枯５００倍液或４６％瓜枯清５００倍液灌根，每穴灌２５０毫升
再加上东台地区大面积主栽品种是易感病的京欣系列、红玉系列和小兰系列等中小果型西瓜品种，枯萎病发生严重。西瓜连片种植，连作田块增加，棉田间套种西瓜，易引发枯萎病。近年来，苏北沿海地区大棚西瓜种植面积较大，枯萎病发生严重。去年东台市大棚西瓜枯萎病发病棚率为４０％，病株率为１０．１２％，是发生最重的一年。４月下旬至５月上旬遇连阴雨天气，出现发病高峰，病害加重
病株根部腐烂，维管束变为褐色，空气湿度大时病部表面出现粉红色霉层。西瓜枯萎病由西瓜尖镰孢菌引起，病菌从瓜苗根部侵入，主要发生在坐果期。发病初期，叶片由根部向上呈失水状萎蔫，中午明显，早晚恢复；以后病叶增多，萎蔫状不可恢复；茎基部缢缩、纵裂，部分病部出现褐色病斑或琥珀色胶状物
合理肥水运筹平衡施肥，控制氮肥用量，增施微肥；施用腐熟、不带病菌的有机肥和饼肥，增施磷钾肥，以减轻枯萎病危害。不大水漫灌，防止病菌随水传播。生产中避免和减少对根的损伤，防止病菌从伤口侵入。雨后及时排水，防止瓜田积水，以降低田间湿度，提高土壤通透性，提高植株抗病能力
发病严重的田块，可与玉米等非瓜类作物实行５年以上轮作或与水稻实行３年以上轮作。水旱轮作换茬选择未种过西瓜和棉花的田块种植，避免病菌在西瓜和棉花之间交互感染