五是采用方法不同，检疫除害处理以化学防治为主，一般病虫害防治不强调单一的防治方法，实行综合防治。三是治理策略不同，检疫除害处理要求彻底消灭，即TPM策略，一般病虫害防治则允许有少量病虫存在，即IPM策略。二是价值取向不同，检疫除害处理着重考虑全局和长远利益，经济效益从以后的生态效益等中补偿，一般病虫害防治则考虑当前、当地利益，在不影响生态效益的前提下注重经济效益。六是处理时间不同，检疫除害处理要求及时发现，及时消灭，一般病虫害防治则注重防治的最佳时机。四是管理对象不同，检疫除害处理的管理对象是危险性病虫及其载体，一般病虫害防治的管理对象是当地主要病虫害及其载体。一是执行者不同，检疫除害处理执行者是检疫机构和检疫人员，一般病虫害防治的执行者是病虫防治机构和防治人员
植物检疫的除害处理和一般的植物病虫害防治都是对植物病虫害的限制措施，但两者有很大的区别：