由于大棚多年连作种植，造成病菌、虫卵积聚。另外，由于保护地施肥种类单一，过量，造成土壤盐分上升，盐害加重。因此，大棚菜地的土壤改良尤为重要
菜田地的土壤条件菜田地应选择土层厚度在50～70厘米，有机质含量2.5～3.5%，全氮0.1～0.15%，全磷0.1～0.25%，质地疏松，耕性好的棕壤土空隙度较大，透气性好，土壤溶液呈中性或偏酸性，具有较强的缓冲能力，施肥后不易出现肥害，施肥不及时也不会出现肥害，施肥不及时也不会出现脱肥现象
若发现土壤酸化，可必用硝酸钙、硝酸钠等碱性肥料，或在土训耕翻时施入少量的生石灰。根据蔬菜类型和发生病虫害的种类，选择药剂，采用撒施、喷雾、灌穴等方法消毒土壤，以控制土传病害的发生。（2）土壤消毒。菜田地的土壤处理（1）对土壤中某种盐分含量超过0.2%的菜田，可进行大水漫灌，冲洗盐分。盐害严重时，可停种1年蔬菜，改种1茬吸盐植物，进行生物脱盐
化学肥料作为速效肥，也是培肥地力的有效方法。培肥菜田应以基施有机肥为主，菜田常用的有机肥主要有人粪尿、畜禽粪、土杂肥和草木灰等，各种有机肥一定要经过充分密封堆积，待其腐熟后再用。对于一次种植多茬收获的蔬菜，有机肥要作基肥一次施入。多年连作的大棚要移棚换上，对耕性差的黏质土要压沙改良，对保水保肥性能低的沙质土要掺黏土改良。大棚菜田地的土训改良冬暖大棚建棚或扣棚前，应进行1次早秋深耕，深度以20～25厘米为宜。基施有机肥时，可结合深耕整地进行，基肥施用量占总用肥量的80%以上。培肥菜田应以基施有机肥为主，菜田常用的有机肥主要掺黏土改良。但应避免连续施用单一种类的化肥，尤其是含氯和硫化物的肥料。另外，人粪尿须衡释后再追施。特殊情况需用有机肥作追肥时，应采取沟施或穴施的方法施肥后覆土、浇水，通风散气，排出有害气体，有机肥追肥量占总施肥量的20%。对大棚菜田施用化肥的分配原则：氮肥总量的20%作基肥，80%作追肥；磷肥总量的60%作基肥，40%作追肥；钾肥总量的50%作基肥，50%作追肥