当然，三四批花开过后，腋芽丛生，就难以控制了。一般品种可改地栽，优良品种则准备留种。像培育品种菊一样。开过花后要将残花摘掉，不使其作子，以免影响下一批花的营养
待真叶刚刚萌发时，就应移栽入小盆中，过早苗弱，过迟伤根，都不利于以后的发育。大约再过10天左右，子叶完全张开。小盆上应作好标记，注明品种。1．育苗：牵牛花子发芽温度为20～30℃，一般在四月末五月初播种（南方还可以提前），按品种分行播在细沙土苗床中，湿度适中时大约10天左右萌发
科学种植牵牛花，必须用盆栽。这样既便于科学管理，又便于展览评比，还便于保证优良品种的采种
正如梅先生所说，牵牛花不怕重肥，可以用马掌、熟麻渣等作底肥。2．定植：小盆中的幼苗长出两三片真叶后，此时根系已发展好，即可定植在中盆中，并预先加好底肥。要经常转盆使阳光照射均匀，使根系发展完备。牵牛花的根系发展需要温度，据日本研究者认为，用黑盆比用红盆吸热好
每次摘心后都应追肥，所用肥料和菊花用的追肥类似。枝蔓成长后即进入花期（一般在定植后一个月），理想的情况是枝蔓的第一叶又生腋芽，第二和第三叶的叶腋发出花苞。待花苞成形后，可将花苞的托叶摘掉，以利花苞发展。3．摘心：牵牛花的真叶长出三四片后，中心开始生蔓，这时应该摘除。为保证养分充分供应花苞而开出大而艳丽的花朵，还可以除掉一些花苞，培育独朵的花，就。注意不使肥水和泥浆沾污叶片（包括子叶），以免叶片脱落。第一次摘心后，叶腋间又生枝蔓，待枝蔓生出三四片叶后，再次摘心，同时结合整形
如出现变种，更应加意留存。第二天清晨取下蜡纸袋，用父本的雄蕊进行人工授粉，然后再用蜡纸袋包扎，一二周后可除去蜡纸袋，但授粉的子包一定要作好标记，作好记录。牵牛花的杂交在选好母本和父本后，在开花的前一天黄昏将花苞上端剪去，然后除去雄蕊，用蜡纸袋包扎。翌年要把所杂交的全部种子种好，待开花后看成果，由之可以研究各种遗传因子的作用。4.留种：好的品种一定要留好种子，待入秋成熟后取种分类标注保存
有经验的牵牛花爱好者可以根据子叶的形状分出优劣，以便早期除去劣种。子叶形状异样，真叶形状异样，花的形状也异样。他们还能根据幼茎的颜色估计出花色来，如白青色为白色花，深紫色为紫色花等等