主要发生在叶片，也为害茎杆，菊花患病初期叶面产生淡黄色斑点，然后隆起呈淡褐色至铁锈色的疱疤状物，由白色逐渐变为黄褐色，而叶正面则为淡黄色斑点，且较微凹陷，不久疱疤突起开裂，在生长中后期的锈褐色粉（病菌、孢子堆）散出，散发出大量黄褐色粉末状孢子。菊花锈病有黑锈病、白锈病、褐锈病等，都是病菌孢子传染的，气候湿润时容易发病。严重时，菊叶上布满病斑、叶片卷曲，叶色黄褐，植株生长不良、衰弱，并且大量落叶
发病期间喷洒80％代森锰锌500倍液，或25％粉锈宁可湿性粉剂1500倍液，或20％萎锈灵乳油400倍液，或25％甲霜灵可湿性粉剂800倍液、5％甲霜铜可湿性粉剂600倍液、75％百菌清可湿性粉剂500倍液，每7至10天喷1次，交替使用，连喷3至4次，可收到良好防治效果。3.发病初期喷洒15%粉锈灵1000倍液，25%萎锈灵1500倍液，80%代森锌500—700倍液，0.5波美度石硫合剂。另外萌芽可喷1次3—4波美度石硫合剂
(1)黑锈病
随风飞散，大面积传染。随后叶片上生出暗黑色椭圆形斑点，叶背表皮破裂后又生出黑色粉末，严重时自下而上全株染病，最后导致叶片干枯。黑锈病是锈病中危害较普遍的一种，开始中叶片表面出现苍白色的小斑点，逐渐膨大呈稍圆形突起，叶背相应处生褐色或暗褐色小疱斑，不久叶背表皮破裂生出成堆的橙黄色粉末为病菌的夏孢子，生长后期生深褐色或暗黑色椭圆形肿斑，破裂后散出栗褐色或黑色粉末为病菌的冬孢子
尤其引进日本品种或从日本引进菊苗、插条时要严格实行检疫。2.实行检疫
叶子表面密生淡褐色或橙黄色的细小斑点，导致叶子枯黄
(3)褐锈病
1.母本植株应保证无病虫害，扦插时用代森锰锌溶液浸泡插穗，可预防插穗带菌传播
防治方法：
(2)白锈病
选高燥地、肥沃砂壤土种植。保持通风良好，光线充足。轮作。清除病叶、病株及残体，集中烧毁。5.清园。忌连作、盆载要换土。肥料要充分腐熟促使植株生长健壮
1片叶上可有许多病斑，甚至布满全叶，严重时致菊株枯死。比黑锈病危害严重。叶子表面发生灰白色圆形病斑，叶背相应处生白色或灰白色小疱，后期变淡褐色或黄褐色，为病菌的冬孢子堆
遇降雨天气，应排清田间积水，以免病菌随水飞溅传播。避免密植，控制肥水，不使土壤过于潮湿。花后要彻底清除病株叶，并集中烧毁，消灭侵染源。4.选择抗锈病品种和无病母株
而黑锈病则由菊柄菌引起。菊花品种间对堀柄锈菌的抗性有差异，上海引进的京白、新兴京白和朝红白等品种感病严重，而桃金山和舞姬等品种抗病能力较强。病原菌一般在植株新芽中越冬，随菊苗繁殖而传播，病原菌喜凉，不耐高温，9-12月发生较多，温度在6℃以下或31℃以上时不易侵染，而温暖多湿季节有利病害发生，在湿度大、光照不足、通风不良、昼夜温差大、10-24℃条件下最易发生，寒冷、阴雨、日暖夜寒、潮湿天气发生较严重。锈病是真菌病害。引起菊花锈病的病原有菊柄锈菌、堀柄锈菌及蒿层锈菌等3种，常见的为前两种。病原为担子菌亚门，白锈病由柄锈菌属引起，冬孢子长椭圆形，棍棒形至纺锤形，黄褐色，顶部圆形成尖突、双细胞，分离处微缢缩，茎部狭窄，表面平滑