可用代森锰锌(0.2千克／公顷)、氧化萎锈灵与百菌清混合剂(0.4－0.8千克／公顷)、15%粉锈宁1000倍液喷雾，都可防治苜蓿锈病。苜蓿的灌水量为土壤饱和持水量的50－60%时，苜蓿生长最为适宜。喷洒除草剂20-30天后，才能放牧或刈割，以免造成中毒事故。从孕蕾到开花前这段时间，可浇水一次，此外，每次刈割之后必须进行灌溉(这在盐碱地上尤为重要)。一般每亩苜蓿每年的灌溉量约为250立方米，一次灌水量为80立方米。灌溉量：苜蓿茎叶繁茂，蒸腾面积大，需水量要比一般作物多。如2，4-D、西马津、乙氧氟草醚等；灭生性除草剂良莠不分，一概触杀，如敌草隆、五氯酸钠甘草磷等。紫花苜蓿发生锈病后，光合作用下降，呼吸强度上升；由于表皮多处破裂，水分蒸腾强度上升，干热时容易发生萎蔫；锈病使苜蓿叶片退绿、雏缩并提前落叶，严重者可减产60%；染有苜蓿锈病的植株含有毒素，不仅影响适口性，而且会导致畜禽食用后中毒。选择性除草剂只杀草而不伤害牧草及作物。化学防除：化学除草剂按其作用分为两大类，一类是选择性除草剂，另一类是灭生性除草剂。在生长期内不宜勤灌，因为紫花苜蓿怕积水，如有积水会导致烂根。人工防除杂草费工费时，且效果不理想，目前主要是通过化学除草。病虫害防治草地因病害、虫害、鼠害会造成大面积减产，牧草品质下降，严重影响牧草的正常生长。杂草种类：危害多年生苜蓿生长的杂草很多，有些杂草危害牧草有一定的范围，而菟丝子对紫花苜蓿危害严重，应重点防治。灌溉次数和时间：在苜蓿全部返青之前，浇一次返青水。牧草的主要病害及其防治：主要病害有苜蓿锈病、霜霉病、褐斑病、白粉病等。防除杂草多年生苜蓿早期生长极为缓慢，容易受杂草危害
因此，苜蓿的田间管理与病虫害防治是提高苜蓿的产量和质量的重要环节，种植户务必要严格把关。对苜蓿进行田间管理及病虫害防治的目的是为了生产高产优质的牧草。灌溉灌溉可使产量提高3－10倍以上。从苜蓿的销售价格来看，如牧草质量的各项指标中如有一项不合格将少收入50－100元／吨
苜蓿蚜虫一般一年发生20余代，常聚集在植株嫩茎、幼芽、顶端心叶和嫩叶、花器上，以刺状吸器吸取汁液，被害牧草；由于缺乏营养，植株矮小、叶片卷缩、变黄，严重时全株枯死。可用50%二嗪农每亩150－200克、80%西维因可湿性粉剂每亩100克进行药物防治。牧草的主要虫害及其防治：紫花苜蓿主要虫害有苜蓿叶象虫、苜蓿蚜虫、麦秆蝇、粘虫、蝗虫等。对苜蓿蚜虫可用50%马拉硫磷乳油、50%杀螟松乳油、25%亚胺硫磷乳油1000倍液、40%乐果乳油1000－1500倍液进行化学防治(注意：使用化学药物防治后，半月内不可放牧或刈割晒制干草)。苜蓿叶象虫一般一年发生一代或两代，第一代幼虫盛期在5月下旬至6月上旬，虫期15－28天，该虫主要危害花基部和叶肉，严重者仅剩叶脉，状如网络