加之朱元璋下葬时曾有13个城门同时出殡和葬于南京朝天宫、北京万岁山等民间传说，因此朱元璋是否真的葬在明孝陵也成为数百年来人们心中挥之不去的谜团。2003年07月03日 07:40 北京晨报 明孝陵是明太祖朱元璋的陵寝建筑，但其地宫的具体位置在哪里，众说纷纭，史无定论
采用高科技手段，结合传统勘探方法探测地宫，终于成功地查明了明孝陵地下玄宫的位置，确认朱元璋就葬。自1997年起，文物工作者对明孝陵进行了长达6年的考古勘探和研究
在独龙阜下数十米处，而且这座地下宫殿保存完好，排除了过去流传的地宫被盗之说
明孝陵与历代帝王陵寝相比，有许多不同之处，其中之一就是墓道弯曲不直。明孝陵地宫墓道偏于一侧的做法，起因是什么，目前尚不知，但这种制度一直影响到明代后来的帝陵规制。通过探测，结果发现竟是两种不同岩石所致。如北京明十三陵中已发掘的定陵，其墓道入口便是偏向左侧，与孝陵墓道正好相反，它们都避免把墓道开在方城及宝城中轴线上却是共同遵循的法则