纵剖病茎，维管束呈浅褐色变色条纹。病株一般不矮缩，还能结少量棉铃，但早期发病重的植株较矮小。病叶边缘向上卷曲，叶脉间出现不规则浅黄色斑块，并逐渐加深至深黄色或褐色，整个叶片呈掌状枯斑。该病一般在棉花现蕾后发生，7～8月开花结铃期达发病高峰。发病严重时，整张叶片枯焦破碎，脱落成光秆。近年来，棉花黄萎病发生呈逐年上升趋势
如何预防黄萎病，可选用科棉4号等抗耐病品种；轮作换茬，与水稻、玉米、小麦、大豆等实行3年以上轮作；种子消毒，用0．3％多菌灵胶悬剂冷浸棉籽14小时；选择前茬不是棉花的地块做苗床，移栽前用内生性生防细菌73a菌液泼浇；保健栽培，减少辛硫磷、甲胺磷、久效磷等有机磷农药的用药次数和浓度，防止棉株受药害而降低抗病能力；不偏施氮肥，氮磷钾配合，增施钾肥，以提高抗病力，减轻病害。在发病初期，及时用内生菌73a菌液灌根，或者用冠菌清、铜大师喷雾，隔7天再防治一次