尿素深施，融肥于土，使肥料处于湿润的土层中，有利于肥效的发挥。四忌浅施尿素浅施养分易挥发，易被杂草消耗。作追肥应穴施于苗旁或沟施在苗侧，深度也应在10至15厘米左右。这样，尿素通过移动大都能集中在根密集层，便于作物吸收利用
一般夏秋季节应在施后2至3天浇水，冬春季节应在7至8天后浇水。三忌施后立即浇水酰胺态的氮素，与土壤胶体间的吸附能力很低，其在土壤中的流动性和淋失性并不比硝态氮肥小。鉴于尿素的这些性能，追施尿素后，在其未转化完毕之前，切勿浇水，否则浪费大。大雨之前不能施用尿素
如混尿素施或同时施，则会加剧尿素中的氮素变成氨而挥发。因此，夏秋季节，尿素与碱性肥应错开3至4天施用，冬春季节应错开7至8天。一忌与碱性肥料混施或同时施碱性肥料包括草木灰、石灰、钙镁磷肥、钢渣磷肥等
若必须作为种肥施用时，要避免种、肥接触，并控制用量。二忌作种肥尿素作种肥，由于集中的缩二脲的毒害作用会使种子失去发芽力，并危及幼苗。同时，因为高浓度的尿素能破坏种子的蛋白质结构，对种子也有毒害和抑制作用，故不宜作种肥