目前，云南省正围绕主要粮食作物和优势特色作物，推动传统“常规育种”向高效“精确育种”转变，探索商业化育种机制，完善种子生产优势区域布局，着力构建现代种业体系。水稻是云南省第一大粮食作物。近年来，省农科院开创云南自育两系杂交稻走出国门先河，高原粳稻选育领先全国，陆稻育种实现从传统系统选育到杂交改良育种的跨越，功能稻米选育走在全国前列，云南农大选育的滇型杂交稻成为世界上唯一能在海拔2000米地区大面积推广的杂交粳稻品种。创造玉米育种三项世界第一的省农科院玉米育种创新，基本解决了我国玉米杂交种遗传基础狭窄的难题，云南农大、省农科院等单位还选育总结出杂交玉米品种及配套栽培技术，获准进入印度尼西亚、马来西亚、越南等周边国家
云南省还构建了完备的马铃薯育种体系，云南冬作马铃薯、彩色马铃薯等新品种选育领先国内；收集、整理、鉴定、保存烟草品种资源1500多份，云南省选育的“云烟87”、“云烟317”等烟草品种在全国大面积推广；月季、满天星、非洲菊等云花自主知识产权品种占全国的一半以上……
从香石竹“云红2号”首开全国自育鲜切花在花卉发达国家获授权先河，到两系杂交稻“云光14号”从激烈竞争中脱颖而出、获越南认定注册大面积推广，近年来，一批源自云南本土的特色优势粮经作物生物育种成果叫响“滇字号”品牌，或遍布云岭，或远销省外，或走出国门，尽展农业高科技魅力
在云南省164家种企中，没有1家注册资金规模达到农业部办证标准，全省杂交稻自给率仅10%，马铃薯脱毒种仅20%，蔬菜、花卉等特色优势产业90%以上是外来品种。育种专家给出的答案是：水稻、玉米、马铃薯、花卉、烟草、甘蔗、茶叶、工业大麻等作物育种独具特色、领先全国，是云南生物育种的亮点所在，但种子企业小散弱、品种研发与生产脱节、良种自给率低等因素，依然是制约云南生物育种产业发展的软肋。农业生物种类覆盖面、生态类型覆盖面、生物产业发展涉及面居全国首位，云南有着得天独厚的优势
开创具有云南特色的生物育种产业，以育种成果升级换代推动现代农业发展，造福于民，云南省农业科技工作者正奋力前行
2000年以来，由云南省农科院牵头，楚雄州农科所等11个州市级农科所组成的生物育种协作攻关组，打破区域界限，实现技术优势互补，育种资源共享，大大加快了新品种选育和示范推广进程。“十五”以来全省审定通过主要农作物新品种525个，主要农作物代商品化供种率由2000年的15%提高到2010年的24%。在国家大力发展生物育种产业和云南省实施“两强一堡”发展战略的机遇面前，云南省瞄准农业科技发展的战略高地，正大力推动发展生物育种战略性新兴产业。令人可喜的是，云南省生物育种产业正在兴起