优良的内含物不但不会削弱其价值，恰恰相反，即使祖母绿有内含物，但顏色生动晶莹翠绿的祖母绿，其价值还是更高于无内含物及裂缝但顏色卻暗淡的祖母绿
由于祖母绿是在以上极复杂激烈的地质条件下生成的，因此有些形成微小裂缝与裂隙，而一些却有着大量的裂缝及内含物。但在极复杂激烈的地质构造过程中，诸如造山构造、变质、浮现和土地的侵蚀，这些原本对立的元素相互结合及结晶成为最美丽的宝石之一。透过放大镜或显微镜我们可以更了解这个独特宝石的內部构造：我们可看到大小不同的裂隙及不同形状的小结晶体或气泡
称为花园的祖母绿有着許多绿色微小植物般的内含物，这个特征证明宝石是天然的。当祖母绿的内含物、裂缝或裂纹变得之多之复杂，研究者很诗意地称它为“花园”（Jardin or Garden）
由于祖母绿生动鲜明的色彩光度，使它成为如此独特的宝石。然而只要瑕疵不严重影响宝石的颜色和透明度，都是可接受的质量。由于这个原因，优质的祖母绿是极珍贵。大型清澈无瑕的祖母绿是十分难得的。然而，真正优质的祖母绿是相当罕见，尤其内含物会影响宝石的顏色与价值，但借由不同的内含物，卻可分辨出宝石产地的不同，及其生长环境