不同作物种子要求的储存温度不同：粮食作物种子要求的适宜温度20～25℃，花生、棉籽、向日葵等油料作物的种子为18～20℃，甘薯薯块的适宜温度为11～15℃。种子入库初期，库内外的温度较高，特别是甘薯窖内极易发生高温，要把温度列为检查的重点。防治鼠害应首先用水泥等物质彻底堵塞鼠洞，然后用毒饵诱杀。如若发生虫害、鼠害，要及时进行防治。防治玉米螟、锯谷盗等害虫，可按200公斤粮食用一片民用磷化铝的比例，将药片用布包好后放入种子内33厘米深处，密封7天即可将害虫杀灭。种子贮存初期，每10天到半月检查一次；储存中期，每20天到1个月检查一次；储存后期，每10天到半月检查一次。种子入库后要跟上检查，发现问题及时解决
因此，千万不能将种子与农药、化肥等有害物质同库贮存。不能与农药、化肥等物品同库存放，因为多数农药、化肥都有程度不同的挥发性和腐蚀性，会为害种子的生活力，使种子的生活力下降
把种子放在垫物之上，使其不与地面接触。种子入库前，将库房清扫干净，用10%石灰水进行彻底消毒后，再通风去潮、将库房晾干，然后用药剂杀灭库房内的病虫害和鼠害。储存场所要干燥、隔热、通风、防潮等条件良好。在地面上铺设垫物，垫物高度距地面50厘米左右为宜。因为任何烟熏和蒸气，都会对种子构成威胁，所以在灶房、粉坊、豆腐房等场所都不能储存保管种子
不同品种的种子，也不宜在同一场地晾晒，防止引起混杂。作物种子收获后，在入库前，要认真搞好晾晒，使其充分干燥，含水量达到入库标准后再入库保管。不同作物种子的安全贮存含水量要求不同：花生为9%，棉籽为11%，大豆、向日葵为12%，小麦、谷子为13%，玉米、高粱为14%，水稻为15%。晒种要选择晴天，在背风向阳处，将地面打扫干净，铺上苇席等垫物后，将种子均匀摊晾在上面。种子不能在水泥地面上和金属器物上晾晒，以免高温烫伤种子。一般种子需晾晒3～5天，每天翻动2～3次，傍晚时入库或就地堆放加盖覆盖物，一直晒到达到安全储存标准含水量时入库保管
种子不能用塑料袋包装，因为塑料袋不透气，易导致种子无氧呼吸而产生有机酸、酒精等有害物质，造成种胚中毒。种子入库前，都要按作物品种的不同，在每袋种子上挂上标签，标签上注明品种名称、数量、级别、含水量、入库时间等。库内存放种子要严防混杂不同作物的种子和同种作物的不同品种，所有种子都要做好标签，分别存放，严防混杂。散装种子，也要按袋装种子的要求放入标签，严防混杂。包装种子，应使用透气的编织袋或麻袋