黄瓜贮藏适温，从简易贮藏的实践来看，似乎可以低于10℃，甚至可以接近0℃。比如北方各地秋冬季的缸贮、酱贮，大白菜包黄瓜贮藏等，但也有采用上述方法贮藏有时见到冷害，据近来国内外，黄瓜贮藏适温为10-13℃，低于10℃出现冷害，相对湿度应达90%以上
故黄瓜贮藏中的主要问题是完熟变质和腐烂。1、贮藏特性。供食的黄瓜是幼嫩果实，含水量很高，收获后组织易脱水变“糠”，特别是受精胚可在采后的嫩果内继续发育成长，而从果肉组织中吸取水分和养分，以致瓜条变形，果梗一端组织萎缩变糠，蔸端则因种子发育而变粗，整个瓜形成棒槌状，并且绿色减奶，酸度增高，品质明显下降，黄瓜脆嫩，易受机械伤害，特别是刺瓜类型，瓜刺易被碰脱造成伤口流出汁液，从而感染病菌腐烂
黄瓜可用气调贮藏，方法与番茄基本相同，适宜的气体组成是氧气与二氧化碳均为2%-5%，有些实验发现黄瓜经气调贮藏后，维管束变褐，瓜内也呈淡黄色并有苦味。2、贮藏方法。这种情况可能与品种有关，或是气体组成不当所致
（3）黄瓜用1∶5虫胶水液加2000×0.000001-4000×0.000001苯来特或用托布津涂被。用上述综合措施，共同瓜可贮40-60天，好瓜率约为85%。北京宣武区菜站提出黄瓜气调贮藏各项指标如下：（1）温度10-13℃。菜站指出，津研1号、2号，北京大刺等品种比长春密刺、八杈等品种耐藏效果好。（4）封闭垛内混入瓜重1/20-1/40的高锰酸钾泡沫载体（泡沫砖碎块用饱和高锰酸钾液浸透），目的是除乙烯。（2）气体组成氧气与二氧化碳均为2%-5%，快速降氧气。（5）氯消毒：剂量和方法同番茄